Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms