Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms