Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Traf3ip1Q149C2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms