Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms