Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms