Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms