Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms