Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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