Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ptprn2P80560 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ptprn2P80560 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ptprn2P80560 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ptprn2P80560 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptprn2P80560 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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