Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms