Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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