Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Dbx1P52950 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Dbx1P52950 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dbx1P52950 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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