Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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