Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprkP35822 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprkP35822 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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