Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms