Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
P18530 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18530 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms