Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms