Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms