Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms