Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifna9P09235 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms