Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa7P02830 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms