Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

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Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a1O88207 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Col5a1O88207 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Col5a1O88207 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Col5a1O88207 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a1O88207 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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