Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms