Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms