Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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H2-Q1O19441 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Q1O19441 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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