Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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