Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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