Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms