Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp17lcG5E8I7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms