Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pla2g4c-203ENSMUST00000108528 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rtp3-203ENSMUST00000199891 2463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Atrip-205ENSMUST00000161521 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pfdn4-202ENSMUST00000075087 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Recql-203ENSMUST00000111803 3389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm10538-201ENSMUST00000189499 1877 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms