Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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Myo5cE9Q1F5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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