Protein–RNA interactions for Protein: D3YX43

Vsig10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10D3YX43 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig10D3YX43 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms