Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms