Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms