Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syngr4Q9Z1L2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms