Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc7Q9WVC5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc7Q9WVC5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc7Q9WVC5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc7Q9WVC5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc7Q9WVC5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc7Q9WVC5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc7Q9WVC5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trpc7Q9WVC5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trpc7Q9WVC5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc7Q9WVC5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms