Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms