Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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