Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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