Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco2Q9DA21 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms