Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms