Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2v1Q9CZY3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms