Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms