Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms