Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms