Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms