Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CherpQ8CGZ0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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