Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc2Q8BKV1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc2Q8BKV1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc2Q8BKV1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc2Q8BKV1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc2Q8BKV1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc2Q8BKV1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc2Q8BKV1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc2Q8BKV1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc2Q8BKV1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc2Q8BKV1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc2Q8BKV1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpc2Q8BKV1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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