Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Atg4dQ8BGV9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4dQ8BGV9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg4dQ8BGV9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg4dQ8BGV9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg4dQ8BGV9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg4dQ8BGV9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Atg4dQ8BGV9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Atg4dQ8BGV9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Atg4dQ8BGV9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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