Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphp3Q7TNH6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp3Q7TNH6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms